Microsoft Safety Scanner je poskytovaný na stiahnutie zadarmo a umožňuje vykonať na vyžiadanie jednorazovú kontrolu počítača a dokáže odhaliť a odstrániť vírusy, spyware a ďalší škodlivý softvér. Jeho hlavnou výhodou je mimo vysokej úspešnosti detekcie aj fakt, že funguje aj v prípade, že je v počítači prítomný ďalší rezidentný antivírusový program. Poskytuje tak vlastne možnosť dvojitej kontroly, napríklad ak bol pôvodný antivírusový program kompromitovaný alebo nedokáže niektoré hrozby odstrániť. Navyše ho môžete pohodlne preniesť aj na USB disku.

Nástroj ako taký obsahuje upravený antivírusový modul svojho väčšieho brata Microsoft Security Essentials (MSE) spolu s jeho najnovšími definíciami, preto jeho platnosť skončí vždy 10 dní po jeho stiahnutí. Ak chcete po desiatich dňoch znovu spustiť skenovanie počítača, je potrebné stiahnuť si jeho novšiu verziu. Používanie tohto nástroja samozrejme nenahrádza klasický antivírusový program, pretože neposkytuje trvalú ochranu, len skutočne vykoná jednorazovú kontrolu počítača na prítomnosť možnej vírusovej nákazy. Tiež nenahrádza Malicious Software Removal Tool (MSRT), ktorý je zameraný na odstránenie konkrétneho škodlivého softvéru a je distribuovaný pravidelne v rámci Microsoft Update.